En el año 200x, solo un año después del Proyecto Caótico Gamma y la supuesta caída del Dr. Wily, surge una nueva amenaza. El Dr. Light recibe una carta del Dr. Cossack, un misterioso científico de Rusia, que afirma ser el mejor ingeniero de robots del mundo. Para demostrar su punto, Cossack planea desatar su ejército de robots como un desafío para el Dr. Light. Con la paz una vez más en riesgo, Mega Man es llamado de su búsqueda de lo esquivo Wily para enfrentarse a los formidables maestros de robots de Cossack. Afortunadamente, esta vez Mega Man está equipado con una poderosa actualización: el Mega Buster, que le permite cargar y disparar tiros de plasma devastadores. ¡Prepárate para un enfrentamiento épico mientras Mega Man pelea para salvar al mundo una vez más!