في المستقبل ليس بعيدًا جدًا ، يتم تحطيم السلام عندما يسبب جيش غامض يقوده شخص يشبه رجل بروتو الفوضى في جميع أنحاء العالم. فجأة ، يتم اختطاف الدكتور لايت ، تاركًا وراءه مجرد ملاحظة ووشاح صفراء كدليل. Mega Man محير من تصرفات "شقيقه" ، لكنه يعلم أنه يجب أن يتصرف بسرعة لإنقاذ الدكتور لايت واستعادة النظام. مسلحًا بمجموعة كبيرة من الضخمة ، وذلك بفضل الدكتور كوساك الرائع ، Mega Man جاهز للعمل. لا يعزز الدكتور كوساك معدات Mega Man فحسب ، بل يعرّفه أيضًا على صديق جديد من الريش يدعى "Beat" للمساعدة في هذه المهمة الجريئة. مع الدكتور كوساك كدليل له ، يشرع Mega Man في مسعى ملحمي للكشف عن الحقيقة وإنقاذ اليوم!