Pada tahun futuristik 200X, Dr. Wily tampaknya telah membalikkan daun baru dan bekerja dengan Dr. Light untuk menciptakan robot penjaga perdamaian bernama Gamma. Tetapi segalanya berubah ketika delapan master robot yang mereka rancang untuk melindungi Peace Go Rogue dan mencuri delapan kristal kekuatan. Terserah Mega Man, bersama dengan anjingnya yang setia terburu -buru, untuk mengejar mereka di berbagai planet pertambangan di ruang angkasa dan memulihkan kristal.

Menambah petualangan, Proto Man, kreasi pertama Dr. Light, muncul kembali setelah setahun bersembunyi. Dikenal sebagai "blues" di Jepang, Proto Man menantang Mega Man di berbagai duel untuk membantunya meningkatkan keterampilannya. Jika Mega Man menang, Proto Man membuka jalan ke depan. Sebelum pertarungan terakhir dengan Dr. Wily, Proto Man mengambil penyamaran "Break Man." Bersiaplah untuk perjalanan yang menyenangkan yang dipenuhi dengan tindakan dan tantangan saat Anda membantu Mega Man menyelamatkan hari!