През футуристичната 200X година д-р Уили изглежда е прехвърлил нов лист и работи с д-р Лайт за създаването на робот за поддържане на мир на име Гама. Но нещата се обръщат, когато осемте майстори на робота, които са проектирали да защитят мира, да изпаднат и да откраднат осем силови кристала. От Mega Man, заедно с неговия лоялен прилив на кучета, е да ги преследва през различни минни планети в космоса и да възстанови кристалите.

Като добавим към приключението, Proto Man, първото творение на д -р Лайт, се появява отново след една година в криенето. Известен като "Blues" в Япония, Proto Man предизвиква Mega Man в различни двубои, за да му помогне да подобри уменията си. Ако Mega Man спечели, Proto Man отваря пътя напред. Преди окончателното показване с д -р Уили, Прото Ман поема прикриването на „Break Man“. Пригответе се за вълнуващо пътешествие, изпълнено с действие и предизвикателства, тъй като помагате на Mega Man да спаси деня!