В футуристическом году 200X доктор Уайли, кажется, сменился и начал работать с доктором Лайтом над созданием робота для поддержания мира по имени Гамма. Но все меняется, когда восемь Робот-Мастеров, созданных ими для защиты мира, переходят на сторону зла и украдают восемь силовых кристаллов. Мега-Мэну, вместе со своим верным псом Рашем, предстоит преследовать их по различным шахтам на планетах космоса и вернуть кристаллы. Добавляя приключения, Прото Мэн, первое создание доктора Лайта, появляется после года скрытности. Известный как "Блюз" в Японии, Прото Мэн бросает вызов Мега-Мэну в различных поединках, чтобы помочь ему улучшить свои навыки. Если Мега-Мэн побеждает, Прото Мэн открывает ему путь вперед. Перед финальным противостоянием с доктором Уайли, Прото Мэн принимает облик "Брейк Мэна". Приготовьтесь к захватывающему путешествию, полному действия и испытаний, помогая Мега-Мэну спасти день!