NESが徐々に衰退し、スーパーNESが注目を集め始めた時期、カプコンはメガマンXに焦点を当てることを決定し、任天堂にメガマン6を北米に持ってくるようにしました。20XX年を舞台に、世界初の「ロボットマスターズトーナメント」が開催され、最高のエンジニアが自らの技術を披露するイベントが始まります。世界中からエンジニア、プログラマー、ファンが集まり、謎めいた富豪「ミスターX」によって組織されたこの興奮を呼ぶイベントに参加します。既知の平和主義者であるライト博士は競技に参加しないことを選び、トーナメントが円滑かつ安全に進行するようにメガマンを送ります。多くの強力なロボットが参加する中、8体がチャンピオンとして輝きます。このスリリングな冒険にメガマンと共に参加し、挑戦に立ち向かい平和を守りましょう！