Después de su victoria inicial sobre la Dark Queen, los Battletoads pensaron que podían relajarse. Pero la paz es de corta duración ya que las defensas de la Tierra se eliminan de repente y una nave espacial masiva, el coloso, aparece desde detrás de la luna. ¡The Dark Queen está de regreso, y esta vez se ha asociado con los Sombros de la serie Double Dragon para conquistar la galaxia! Para abordar esta nueva amenaza, los Battletoads unen fuerzas con los legendarios Lee Brothers, Billy y Jimmy. Juntos, este intrépido equipo de cinco se dirige a una misión épica para derribar a la Reina Oscura y sus aliados, salvando el universo de sus malvados planes.