หลังจากชัยชนะครั้งแรกของพวกเขาเหนือราชินีแห่งความมืด Battletoads คิดว่าพวกเขาสามารถผ่อนคลายได้ แต่ความสงบสุขนั้นมีอายุสั้นเนื่องจากการป้องกันของโลกถูกกำจัดออกไปและยานอวกาศขนาดใหญ่ที่ยักษ์ใหญ่ปรากฏขึ้นจากด้านหลังดวงจันทร์ The Dark Queen กลับมาแล้วและคราวนี้เธอได้ร่วมมือกับ Shadow Warriors จากซีรี่ส์ Double Dragon เพื่อพิชิตกาแล็กซี่! เพื่อจัดการกับภัยคุกคามใหม่นี้ Battletoads ได้เข้าร่วมกองกำลังกับ Lee Brothers, Billy และ Jimmy ในตำนาน ร่วมกันทีมที่ไม่เกรงกลัวห้าคนนี้ได้ออกไปปฏิบัติภารกิจมหากาพย์เพื่อกำจัดราชินีแห่งมืดและพันธมิตรของเธอช่วยจักรวาลจากแผนการชั่วร้ายของพวกเขา