Super Monkey Ball Jr. trên GBA về cơ bản là anh em họ di động, hơi khó chịu hơn của các trò chơi console. Bạn vẫn nghiêng trên sân khấu để lăn con khỉ của mình trong một quả bóng về phía mục tiêu, nhưng các điều khiển cảm thấy hơi cứng hơn, làm quen với một số người quen với phiên bản Gamecube mượt mà hơn. Các cấp độ có kích thước cắn, hoạt động cho các vở kịch nhanh, mặc dù một số trong số những người sau này có được sự tàn bạo với quan điểm giới hạn của GBA. Không tệ cho việc chuyển thể cầm tay, nhưng bạn sẽ bỏ lỡ những vật lý mượt mà.